Fluorescencija u Situ hibridizaciji
Fluorescentna in situ hibridizacija (FISH) je jedna od nekoliko tehnika koje se koriste za pretraživanje DNK ćelija, tražeći prisustvo ili odsustvo specifičnih gena ili dela gena.
Mnogi različiti tipovi karcinoma su povezani sa poznatim genetskim abnormalnostima. I genetskim, ne govorimo samo o nasledstvu. Tokom celog života, ćelije mogu napraviti greške kada se dele i raste.
Mutacije u DNK koje su povezane sa rakom mogu se akumulirati u ovim ćelijama.
Kako funkcioniše FISH?
FISH je tehnika koja koristi fluorescentne sonde za detekciju specifičnih gena ili delova gena (DNK sekvence). Osoblje laboratorije u medicinskom centru i onkologi koriste FISH da pomognu u procjeni pacijenata koji mogu imati rak, a ponekad i nadgledati pacijenta koji je već bio dijagnostikovan rakom i liječio.
FISH se može uraditi koristeći različite vrste uzoraka prema lokaciji i tipu raka koji se sumnja: tumorske ćelije dobijene iz periferne krvi, iz biopsije koštane srži ili biopsije limfnih čvorova i formalin fiksiranog parafinskog ugrađenog tkiva (ovo se odnosi na uzorak tkiva koji se obrađuje u laboratoriji i ugrađen u tip voska, čineći ga čvršćim, tako da se može rezati na tanke delove i montirati za pregled pod mikroskopom).
Šta znači slova?
"H" u FISH-u odnosi se na hibridizaciju.
U molekularnoj hibridizaciji, označena DNK ili RNA sekvenca se koristi kao sonda - ako želite, zamislite crvenu Lego ciglu. Sonda se koristi za pronalaženje kolone Lego cigle ili DNK sekvencu u biološkom uzorku.
DNK u vašem uzorku je kao gomile Lego opeka, a većina cigli u ovim gomilama neće odgovarati našoj crvenoj sondi.
A sve vaše cigle uredno su organizovane u 23 parova opeke - svaka gomila je jedan od vaših parnih homolognih hromozoma, više ili manje. Za razliku od Lego opeke, naša crvena Lego sonda je kao jak magnet i pronalazi njegovu utakmicu bez potrebe da se razvrstavaju kroz šipove.
"F" se odnosi na fluorescenciju. Naša crvena proba može se izgubiti u gomilu cigle, tako da je obeležena bojom fluoroscentne boje tako da će se sjajiti. Kada pronađe svoj meč između 23 uparenih šipova, fluorescentna oznaka otkriva svoju lokaciju. Dakle, sada možete videti kako istraživači i kliničari mogu da koriste FISH da bi pomogli u identifikovanju gde (gde se nalazi ili koji hromozom) određeni gen nalazi za određenog pojedinca.
"I" i "S" stoje na licu mesta . Ovo se odnosi na činjenicu da naša crvena Lego opeka traži njegovu utakmicu u uzorku koji ste dali .
Šta je sa specifičnim krvnim plućima?
FISH i druge in situ hibridizacijske procedure koriste se za dijagnozu različitih hromozomskih abnormaliteta - promjene u genetičkom materijalu, promjene hromozoma, uključujući sljedeće:
Brisanje - deo hromozoma je nestao
Translacija - deo jednog hromozoma se razbija i stapa na drugi hromozom
Inverzija - dio hromozoma se lomi i ponovo se vraća, ali u obrnutom redosledu
Dupliranje - deo hromozoma je prisutan u previše kopija unutar ćelije
Svaka vrsta raka može imati svoj skup hromozomskih promjena i relevantnih sondi. FISH ne pomaže samo u identifikaciji inicijalnih genetskih promena u procesu oboljenja kao što je rak, ali se takođe može koristiti za praćenje odgovora na terapiju i remisiju bolesti.
Genetske promjene koje je otkrio FISH ponekad nude dodatne informacije o tome kako se kancer pojedinca može ponašati, na osnovu onoga što je u prošlosti primećeno kod ljudi sa istom vrstom raka i sličnim genetskim promenama. Ponekad se FISH koristi nakon što je već postavljena dijagnoza, kako bi se prikupile dodatne informacije koje bi mogle pomoći u predviđanju ishoda pacijenta ili najboljeg lečenja.
FISH može identifikovati hromozomske abnormalnosti kod leukemija , uključujući i hroničnu limfocitnu leukemiju (CLL). Za hroničnu limfocitnu leukemiju / mali limfocitni limfom, FISH dozvoljava pacijentima da saznaju svoju prognostičku kategoriju: dobar, srednji ili siromašan. Kod akutne limfoblastne leukemije (ALL), genetika leukemičnih ćelija može vam reći o nivou rizika od raka i pomoći u vođenju terapeutskih odluka.
FISH paneli su takođe dostupni za limfom, višestruki mielom, proliferativne poremećaje plazma ćelija i mielodisplastični sindrom. U slučaju limfoma mantelnih ćelija, na primjer, postoji translokacija koju FISH može detektovati nazvanim GH / CCND1 t (11; 14) koji je često povezan sa ovim limfomom.
Zašto FISH?
Prednost FISH-a je to što se ne mora izvoditi na ćelijama koje se aktivno dele. Citogenetsko testiranje obično traje oko tri nedelje, jer ćelije raka moraju rasti u laboratorijskim jelima oko 2 sedmice prije nego što se mogu testirati. Nasuprot tome, FISH rezultati su obično dostupni iz laboratorije u roku od nekoliko dana.
> Izvori:
> Cytogenetic Testing CPT kodovi raka.
> Fluorescencija u hibridizaciji Situ (FISH). http://www.genome.gov/10000206#al-2.
> Fluorescencija u hibridizaciji Situ (FISH). http://www.nature.com/scitable/topicpage/fluorescence-in-situ-hybridization-fish-327.
> Wolff DJ, Bagg A, Cooley LD i dr. Uputstvo za fluorescenciju u testiranju hibridizacije sita u hematološkim poremećajima. Časopis za molekularnu dijagnostiku: JMD. 2007; 9 (2): 134-143.